Auditor Halal berperan penting pada proses tahapan pengajuan sertifikat halal. Sebelum suatu produk mendapatkan sertifikasi halal dari BPJPH ada tahapan dimana Auditor Halal harus memeriksa dan/atau menguji kehalalan produk. Sebagaimana dalam Peraturan Pemerintah No.39 Tahun 2021 Auditor Halal adalah orang yang memiliki kemampuan melakukan pemeriksaan kehalalan produk dan menguji kehalalan bahan berdasarkan implementasi Sistem Jaminan Halal (SJH) sebelum di tetapkannya kehalalan suatu produk oleh BPJPH. Berdasarkan amanat dalam Pasal 15 Undang-Undang Nomor 33 Tahun 2014 tentang Jaminan Produk Halal, Auditor Halal memiliki tugas:

a. memeriksa dan mengkaji bahan yang digunakan;

b. memeriksa dan mengkaji proses pengolahan produk;

c. memeriksa dan mengkaji sistem penyembelihan;

d. meneliti lokasi produk;

e. meneliti peralatan, ruang produksi, dan penyimpanan